Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GLI3P10071 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GLI3P10071 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GLI3P10071 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GLI3P10071 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GLI3P10071 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GLI3P10071 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GLI3P10071 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms