Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFTA3P0C7M3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFTA3P0C7M3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms