Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPM2P07951 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM2P07951 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM2P07951 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM2P07951 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms