Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CLEC3BP05452 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms