Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR3DP05423 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
POLR3DP05423 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms