Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EGFRP00533 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EGFRP00533 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EGFRP00533 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EGFRP00533 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EGFRP00533 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms