Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SNAPINO95295 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNAPINO95295 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms