Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ECM2O94769 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM2O94769 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM2O94769 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM2O94769 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ECM2O94769 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ECM2O94769 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ECM2O94769 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ECM2O94769 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms