Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEBLO76041 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEBLO76041 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEBLO76041 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEBLO76041 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEBLO76041 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEBLO76041 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEBLO76041 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEBLO76041 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms