Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F6O75461 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
E2F6O75461 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms