Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GRIN3BO60391 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRIN3BO60391 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms