Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ACTN4O43707 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN4O43707 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms