Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRXO43186 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRXO43186 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRXO43186 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRXO43186 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRXO43186 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRXO43186 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CRXO43186 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CRXO43186 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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