Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PLXNB1O43157 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PLXNB1O43157 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms