Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGFO15240 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGFO15240 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGFO15240 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VGFO15240 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VGFO15240 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VGFO15240 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VGFO15240 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VGFO15240 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VGFO15240 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
VGFO15240 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VGFO15240 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VGFO15240 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VGFO15240 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms