Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms