Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF839A8K0R7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF839A8K0R7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms