Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KNCNA6PVL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KNCNA6PVL3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms