Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GOLGA6CA6NDK9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GOLGA6CA6NDK9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms