Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAP1LC3B2A6NCE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms