Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PARP3Q9Y6F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PARP3Q9Y6F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms