Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAD54BQ9Y620 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAD54BQ9Y620 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms