Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SRPRBQ9Y5M8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPRBQ9Y5M8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms