Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP3Q9Y2W1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms