Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NWD2Q9ULI1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NWD2Q9ULI1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms