Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PACSIN3Q9UKS6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms