Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSRAQ9UJ68 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms