Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN8Q9UBY8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms