Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNG4Q9UBN1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNG4Q9UBN1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms