Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SIPA1L2Q9P2F8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms