Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TVP23BQ9NYZ1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms