Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAB6BQ9NRW1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB6BQ9NRW1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210 ms