Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RTN4Q9NQC3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms