Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BRMS1Q9HCU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BRMS1Q9HCU9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms