Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TDRD3Q9H7E2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TDRD3Q9H7E2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms