Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TAF1DQ9H5J8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TAF1DQ9H5J8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms