Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MED28Q9H204 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MED28Q9H204 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms