Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF3Q9H094 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF3Q9H094 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms