Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC90BQ9GZT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms