Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF17Q9BXT8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms