Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLF1Q9BQI6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLF1Q9BQI6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms