Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SGIP1Q9BQI5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms