Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF15Q99988 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF15Q99988 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms