Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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SAMD8Q96LT4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD8Q96LT4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SAMD8Q96LT4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD8Q96LT4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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