Protein–RNA interactions for Protein: Q96LK0

CEP19, Centrosomal protein of 19 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP19Q96LK0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP19Q96LK0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP19Q96LK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CEP19Q96LK0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms