Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKNOX2Q96KN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PKNOX2Q96KN3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms