Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MFSD3Q96ES6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms