Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C18orf8Q96DM3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C18orf8Q96DM3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms