Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCTD12Q96CX2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCTD12Q96CX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms