Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf3Q8WVX3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C4orf3Q8WVX3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms